流行病学标志

• 流行病学标记是生物学标记，其用于表征微生物或基于微生物分离株的遗传变异的基因组区分。

流行病学标志的用途

• 流行病学标记主要用于应变键入。
• 它用于：
  • 分类微生物的分离物
  • 目录遗传变异
  • 在微生物物种或属之间定义相关性或缺少它
• 它可以应用于感染控制：
  • 确认机构疫情
  • 确定似乎是散发性感染病例的爆发
  • 确定最近感染或迅速进展疾病的危险因素
  • 在疾病传播中设计干预
  • 评估干预的疗效
  • 定义致病生物的涂抹方式。MRSA，VRE和ESBL生产生物体
  • 跟踪公共卫生病原体的地理传播。
• 通常进行，以阐明来自不同源的两个分离株是否表示相同的菌株或不同的菌株，以便为流行病学目的提供数据。

流行病学标志物的特征

流行病学标记应该是：

• 通常稳定以区分相关和无关的菌株
• 货源充足
• 易于检测
• 在菌株中常见

图像来源：https://i.ytimg.com/vi/quk-dh65ihy/maxresdefault.jpg.和https://www.ck12.org/book/cbse_biology_book_class_xii/section/8.5/

表型和遗传标记

A.表型标志物和表型方法

• 生物体的表型是生物体可观察特征或特征的复合物，包括其形态或物理形态和结构;其发展过程;其生化和生理特性;其行为，以及行为的产品。
• 用于表征生物体这些特征的标记被称为表型标志物。
  • 生物型化
  • 抗微生物易感性测试（抗诊断）
  • 血清型
  • 噬菌体打字
  • 多焦酶电泳
  • 聚丙烯酰胺凝胶电泳细胞蛋白质
  • 免疫印迹指纹识别

表型标志物的缺点

• 菌株之间的歧视差
• 劳动密集，长程序
• 产生可变结果，一些不适用于所有微生物

B.遗传标志物和遗传（基于DNA）方法

• 遗传标记是可以直接键入的DNA序列中的变体。
• 它是一种基因或DNA序列，其染色体上的已知位置可用于鉴定个体或物种。
• 在常规孟德尔模式之后，标记从父母传播到后代，并且遗传标记的染色体位置通常已知。
• 映射研究的最终目的是鉴定与疾病易感性相关的基因，以提高我们对疾病发病机制的理解，并促进适当的预防策略的发展。
  • 质粒指纹识别
  • 染色体的限制性内切核酸酶分析
  • 具有常规电泳的DNA
  • 核糖型
  • 脉冲场凝胶电泳（PFGE）
  • 扩增方法 - PCR
  • 多点序列打字
  • 基因组测序- 最可靠的方法

优点

• 稳定，避免与基因表达相关的问题
• 广泛适用于一系列微生物

坏处

• 昂贵的创业成本
• 劳动密集型

参考

1. https://www.scribd.com/presentation/6694207/lecture-9-bacteral-epidemiological-markers.
2. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/3377561.
3. https：//link.springer.com/article/10.1007/S10626-3.
4. http://cgil.uoguelph.ca/qtl/phenotypicmarkers.htm.
5. https://www.sigmaaldrich.com/life-science/molecular-biology/cloning-and-expression/learning-center/definitions.html.
6. https://pdfs.semanticscholar.org/9831/2ed7502919fc4ec64b8bd1c4e3a662fa391b.pdf.
7. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/8923138.
8. http://www.biotech.iaState.edu/publications/mendel/moduleiip1.pdf.
9. 公园，K。（N.D.）。Park的预防和社会医学教科书。
10. Gordis，L.（2014）。流行病学（第五版。）。费城，帕：elsevier saunders。