粪便是在消化过程中产生的未被消化的食物和其他废物，通过肛门/泄殖腔排出消化道。粪便培养是一种微生物试验，用于检测引起胃肠道感染的微生物。细菌、病毒、原生动物和寄生虫(蠕虫)是胃肠道和相关器官感染的罪魁祸首。这些微生物可以在粪便中检测到。细菌是引起肠胃炎的常见原因，包括腹泻、溃疡、呕吐、食物中毒等。以大便为样本，在培养基中培养引起胃肠道感染的细菌。凳子上满是垃圾正常菌群因此，从正常菌群污染中分离出特定的病原体是很困难的。
表的内容
从粪便中分离的细菌清单
| 革兰氏阳性细菌在凳子上 | 革兰氏阴性细菌在凳子上 |
| 梭状芽孢杆菌。 葡萄球菌。 肠球菌。 芽孢杆菌。 单核细胞增多性李斯特氏菌 |
大肠杆菌 克雷伯氏菌。 沙门氏菌型 志贺氏杆菌。 幽门螺杆菌 鼠疫的。 普罗透斯。 弯曲杆菌。 弧菌。 拟杆菌属。 梭菌属nucleatum |
粪便中发现的革兰氏细菌和革兰氏细菌
大肠杆菌在凳子
大肠杆菌是革兰氏阴性，棒状，乳糖发酵，兼性厌氧，中嗜大肠菌群属细菌埃希氏杆菌属在肠杆菌科家庭。大肠杆菌是人类胃肠道的正常菌群，所以它们存在于粪便中被认为是正常的。但是，几种病原菌株大肠杆菌会导致危险的腹泻疾病
致病性大肠杆菌(EPEC)，肠聚集性大肠杆菌(EAEC)大肠杆菌(EHEC);产肠毒素大肠杆菌(ETEC){或产志贺毒素大肠杆菌(STEC)或产维罗毒素大肠杆菌(VTEC)}，侵入性大肠杆菌(EIEC)，扩散粘附大肠杆菌(DAEC)致病性菌株是什么大肠杆菌与多种胃肠道感染有关，包括腹泻。
大肠杆菌O157:H7(产志贺毒素大肠杆菌)是世界范围内严重出血性腹泻和流行性腹泻暴发的常见原因之一。
克雷伯氏菌。在凳子
克雷伯氏菌是一种革兰氏阴性，棒状，兼性厌氧和形成荚膜大肠菌属肠杆菌科。克雷伯氏菌spp．在脊椎动物的胃肠道中很常见。然而，他们是负责胃肠炎的情况下削弱免疫条件或任何物理损伤的胃肠道。
k .肺炎是在克罗恩病、溃疡性结肠炎和结直肠癌等胃肠道疾病患者的粪便中分离出的常见物种。
k . oxytoca是另一种有报道的出血性肠炎。产毒k . oxytoca见于坏死性小肠结肠炎、血性腹泻及其他胃肠炎。
k . quasipneumoniae是另一种会引起机会性肠胃炎的物种。多见于长期服用抗生素导致肠道天然菌群紊乱的患者。
沙门氏菌。在凳子
沙门氏菌是革兰氏阴性，棒状，有鞭毛，兼性厌氧γ变形杆菌科的一个属肠杆菌科．它常见于人类胃肠道和受粪便污染的环境方面。沙门氏菌。会引起食物中毒、腹泻和伤寒。
美国血清血清素可引起人类几种形式的肠胃炎。肠沙门氏菌亚种血清型伤寒和副伤寒是引起肠道热(伤寒和副伤寒)的原因。在使用抗生素前，可在肠道发热患者的粪便中进行分离。
Non-typhoidal沙门氏菌(nt)是全世界引起肠胃炎的主要原因。它们通常引起自限性胃肠炎，但在婴儿和免疫抑制患者中，病例可能是致命的。年代．血清型沙门氏菌感染,年代．血清血清肠炎是沙门氏菌胃肠炎最常见的血清疾病。
志贺氏杆菌。在凳子
志贺氏杆菌是革兰氏阴性、棒状、不动、兼性厌氧γ变形杆菌科的一个属肠杆菌科相关的基因大肠杆菌．它是导致人类肠道感染志贺氏菌病的原因，是世界范围内腹泻(细菌性痢疾)的主要原因。
痢疾杆菌是引起志贺氏菌病的主要物种。痢疾杆菌亚型1 (SD1)产生志贺毒素。它导致最严重的志贺氏菌病，如严重痢疾，并伴有电解质失衡、癫痫和溶血性尿毒症综合征(HUS)等全身并发症，死亡率最高。
美国flexneri是另一种引起志贺氏菌病的常见物种。它是东南亚大多数志贺氏菌病的罪魁祸首。它主要导致一种较轻形式的腹泻，但在某些情况下，它们被报告为严重形式，包括溶血性尿毒综合症和癫痫。
美国sonnei而且鲍氏血清是一种较温和形式的志贺氏菌病的原因。
弧菌。在凳子
弧菌是一个革兰氏阴性，杆状(逗号状)，运动，无孢子，兼性厌氧γ变形菌属弧菌科具有特征2染色体。它会导致水传播胃肠炎。
霍乱弧菌是导致霍乱爆发的最重要的致病物种。它导致了大约69个国家的地方性霍乱。能够产生霍乱肠毒素的菌株可引起严重的霍乱，如果不经治疗，死亡率为> - 50%。霍乱弧菌O1和O139是引起流行性霍乱暴发的最常见血清型。
诉parahaemolyticus第二常见的是什么弧菌导致细菌性肠胃炎的细菌，主要分布在亚洲地区。然而，严重程度远低于霍乱弧菌感染。
创伤弧菌是另一种引起腹泻、呕吐和发烧的轻度胃肠炎的物种。
幽门螺杆菌在凳子
幽门螺杆菌是一种革兰氏阴性、螺旋状、微嗜氧变形杆菌属，隶属于幽门螺杆菌科。它们适应人类胃的酸度。
幽门螺旋杆菌通常存在于大多数人的十二指肠。但在某些情况下，它们会导致胃肠道炎症、胃炎、溃疡、腹泻、胃癌和其他胃肠道问题。
鼠疫的。在凳子
鼠疫是革兰氏阴性，球杆菌，兼性厌氧γ变形杆菌科的一个属Yersiniaceae。
y enterocolitica约有2%的肠胃炎与之相关。它通常被低估，因为大多数病例是自限性的，但肠小肠结肠炎的病例通常在儿童和年轻人中很高。
鼠疫耶尔森氏菌属,相关的肠胃炎发病率相对较低。
y伪是另一种很少引起人类食源性感染的物种，主要是在寒冷的地方。
普罗透斯。在凳子
普罗透斯是一种革兰氏阴性，棒状，有氧，兼性厌氧运动细菌家族肠杆菌科最著名的是它们的蜂群。变形杆菌spp．是胃肠炎、阑尾炎、克罗恩病、结肠炎和鼻胃管定植的原因。
p .奇异君子兰是最普遍的普罗透斯物种在肠胃炎。p .寻常的而且p . penneri很少涉及胃肠道感染。
梭状芽孢杆菌。在凳子
梭状芽胞杆菌是一种革兰氏阳性，棒状，严格厌氧，形成孢子的细菌科Clostridiaceae．
梭状芽孢杆菌是引起医院腹泻的重要原因之一。产毒菌株可引起几种形式的胃肠炎，主要是腹泻和结肠炎。
c . perfringens是另一种与急性胃肠道感染有关的物种。它对食物中毒事件负有责任。它会导致轻度腹泻到重度坏死性小肠结肠炎。它们产生A型和C型毒素，导致腹泻疾病。
葡萄球菌。在凳子
葡萄球菌是属于革兰氏阳性，过氧化氢酶阳性的球菌属Staphylococcaceae在显微镜下，它通常以产生葡萄状的葡萄簇而闻名。它们是皮肤上的正常菌群。
金黄色葡萄球菌是产生葡萄球菌肠毒素(SEs)的主要人类病原体葡萄球菌食物中毒．它是食物中毒的主要原因之一。
肠球菌spp在凳子
肠球菌是一种革兰氏阳性，兼性厌氧，乳糖发酵球菌(双球菌)的家族细菌Enterococcaceae具有耐受胆盐浓度高达40%的能力。它们与胃肠道共生，很少与胃肠道感染相关。它们与腹腔内感染和胃炎有关。大肠hirae而且e·杜兰在一些病例中被诊断为胃炎的病因。Vancomycin-resistant粪大肠是另一种引起肠胃炎的物种。
弯曲杆菌。在凳子
弯曲杆菌是弯曲杆菌科的一个革兰氏阴性、杆状(逗号状)、微嗜氧可动菌属。它是引起弯曲杆菌病的胃肠道细菌感染的原因。
c .空肠是儿童和成人急性细菌性胃肠炎最常见的病因之一。它会引起腹泻、呕吐和腹痛。
李斯特菌。在凳子
李斯特菌是一种革兰氏阳性，杆状，无孢子，兼性厌氧细菌，属于李斯特菌科。它会导致一种叫做李氏杆菌病．
l . monocytogenes可引起急性、自限性、发热性胃肠炎和侵袭性胃肠炎。李斯特菌胃肠炎的死亡率非常高，是食源性疾病，死亡率第三高。
拟杆菌spp．在凳子
拟杆菌是拟杆菌科的一种革兰氏阴性、棒状、抗胆汁、不产孢、可动或不可动的专性厌氧细菌。它们是人类胃肠道菌群的一部分。
b . fragilis是唯一一种在肠道内形成脓肿的物种。它们有一个胶囊，并产生一种能导致组织破坏的毒素。如果不及时治疗，它们会破坏肠壁，引起腹内败血症和阑尾炎。它的死亡率为19%，如果不治疗，死亡率会上升到60%。
梭菌属nucleatum在凳子
梭菌属是梭菌科的一个革兰氏阴性、无孢子、杆状厌氧菌属。f . nucleatum被发现与结直肠癌有关。
芽孢杆菌。在凳子
芽孢杆菌是杆菌科的一个革兰氏阳性、杆状、形成内生孢子的好氧或兼性厌氧细菌属。
b的仙人掌是引起食物中毒的常见病原体之一。它会导致呕吐综合征或腹泻综合征。
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