地球生物基因组计划(EBP)

  • 地球生物基因组计划(EBP)是一项全球倡议,旨在对整个地球的真核生物的遗传密码进行排序;大约150万种已知物种,包括所有已知的植物、动物、原生动物和真菌。
  • 它的目标是在10年内对所有真核生物的基因组进行测序和编目,并于2018年11月1日正式启动。
  • 上一个具有类似规模和重要性的项目是历时13年绘制人类遗传密码的人类基因组计划(human Genome project),该计划于2003年完成。
  • 47亿美元的EBP旨在建立一个研究广泛的动植物物种的资源。
  • 这项长达十年的研究成果将成为科学家们的巨大资源,提供许多潜在的见解,包括环境变化如何在遗传水平上影响生命系统。

地球生物基因组计划(EBP)

地球生物基因组计划(EBP)的预期效益

该倡议将建立一个开放的生物信息DNA数据库,为科学研究提供一个平台,并支持环境和保护倡议。

  • 测序所有已知的真核生物基因组将彻底改变对生物学和进化的理解。
  • 它有望加强保护、帮助保护和恢复生物多样性的努力。
  • 为农业和医学领域的研究人员提供新的资源。
  • 为社会和人类福利创造新的效益。
  • 该项目还为治疗感染和抗衰老药物开辟了新途径,甚至为解决粮食短缺和开发创新生物材料开发了新方法。

地球生物基因组计划(EBP)目标

EBP确定了一套广泛的科学目标,并预测了对社会和人类福利的经济、社会和环境回报。EBP的目标如下。

1.修正和重振我们对生物学、生态系统和进化的理解:

  • 更好地理解所有已知生物之间的进化关系。
  • 充分阐明地球上物种的时间、起源、分布和密度。
  • 生成新的知识生态系统组成和功能。
  • 发现新物种(80-90%的真核生物多样性)。
  • 阐明基因组进化(从基因到染色体)。
  • 发现描述和驱动进化过程的基本定律。

2.促进生物多样性的养护、保护和更新:

  • 确定气候变化对生物多样性的作用。
  • 阐明人类活动(污染、栖息地侵占等)和入侵物种如何影响生物多样性。
  • 为稀有和濒危物种制定循证保护计划。
  • 创造基因组资源以恢复受损或枯竭的生态系统。

3.最大化社会和人类福利的回报(生态系统服务和生物资产):

  • 为人类健康开发新的药用资源。
  • 加强对流行病的控制。
  • 确定新的遗传变异以改进农业(例如,产量,抗病性)
  • 发现新的生物材料、新能源和生物化学。
  • 改善环境质量(土壤、空气、水)

地球生物基因组计划(EBP)路线图

图:地球生物基因组计划(EBP)路线图,来源:https://www.earthbiogenome.org/

地球生物基因组计划(EBP)合作

该项目将从全球各地吸引人力。

  • 来自全球的17个机构,包括美国、英国、中国、德国、丹麦和巴西,签署了一份谅解备忘录,承诺各机构为实现该项目的共同目标而共同努力。
  • 此外,15个科学界以及国家和区域项目也隶属于EBP。
  • 最大的承诺是由惠康桑格研究所做出的,它将领导英国对EBP的贡献,通过对整个不列颠群岛的6.6万种真核生物进行测序。
  • 来自中国深圳的北京华大基因研究所(BGI)的一组中国研究人员计划对10000种植物进行测序。
  • 全球蚂蚁基因组联盟计划为这项巨大的努力贡献200个蚂蚁基因组。
  • 类似地,美国农业部正在努力对农业上重要的昆虫和螨类的100个基因组进行测序。
  • EBP活动目前由参与组织以及非公募基金会、政府组织和众筹来源提供资金。

参考文献

  1. https://www.firstpost.com/tech/science/dna-of-all-life-on-earth-to-be-sequenced-in-massive-genome-project-report-5491001.html
  2. https://www.ucdavis.edu/news/international-consortium-officially-launches-earth-biogenome-project-london/
  3. https://www.sciencedaily.com/releases/2018/04/180423155054.htm
  4. https://www.futuretimeline.net/blog/2018/11/4.htm
  5. https://www.earthbiogenome.org
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对“地球生物基因组计划(EBP)”的两点思考

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