样品采集和诊断COVID-19（SARS-COV-2）

经过

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标本采集

由于Covid-19是一种传染性呼吸道感染，因此应收集呼吸材料，最小：

  1. 上呼吸道标本：鼻咽和咽拭子或患者洗尚能移动的。
  2. 下呼吸道标本：痰（如果产生）或气管内吸出或患者更严重呼吸道疾病支气管肺泡灌洗。
  • 作为COVID-19病毒在血液和粪便中检测到额外的临床标本可以被收集。
  • 在死者的患者的情况下，包括肺组织尸检材料的收集应予以考虑。
  • 在回收的患者中，成对血清（急性期和恢复期）可以是有利的，以限定例为血清学检测变得可用回顾性。

样品采集和诊断COVID-19

图：样品采集和COVID-19的诊断，以创建biorender.com

包装和临床标本的出货

  • 病毒检测标本采集后必须尽快到达实验室。
  • 如果可能发生延迟，则可以在2-8°C下储存和发运的试样，如果可能发生延迟，则应使用病毒传输培养基（VTM）。
  • 标本可以被冷冻至 - 20℃或理想地-70℃并在干冰上运送，如果进一步延迟的预期。然而，重要的是避免重复冻结和解冻的标本。
  • 潜在COVID-19样品，其他国家也应该遵循联合国规章范本，并根据运输方式的任何其他必要的法规含病毒所使用的运输。

COVID-19的诊断

  • 所有与COVID-19的测试是在遵循生物安全的做法进行。

核酸扩增试验（NAAT）（RNA检测）

核酸扩增试验（NAAT）（RNA检测）

图：雅培实时SARS-CoV的-2测定。图片来源：雅培公司

  • COVID-19的正规确认基于检测病毒RNA的特定序列由NAAT如实时反转录聚合酶链式反应（qRT-PCR）。
  • 结果可以是通过核酸测序确认必要的时候。
  • 它们靶向病毒基因包括来自像鼻咽癌，口咽拭子和甚至血液样本的N，E，S和的RdRP基因。
  • RNA提取是在BSL-2或等效设施中的生物安全柜中工作要做。样品应不RNA提取之前进行加热。
  • 所述样品可以通过测序病毒的部分或整个基因组，只要该序列目标是在从所用的NAAT分析探测到的扩增子更大或不同来进一步识别。

阅读更多：COVID-19实时SARS-CoV的-2测定

血清学检测

  • 血清学检测也没有惯常用于人类冠状病毒感染的诊断，由于缺乏商业试剂。
  • 当快速抗原检测和/或分子测定既不可用也不稳定，血清学可以被用作附加的诊断工具。
  • 作为感染发作五天后检测到IgM和IgG抗体配对的血清样品（在急性和恢复期）应当收集。
  • 血清学调查可以帮助爆发的攻击速度和程度的持续暴发和回顾性评估的调查。
  • 有多种类型的冠状病毒的诊断进行血清学检查：
    • 补充固定试验
    • 埃莉莎
    • 血凝试验
    • 免疫荧光等。

病毒测序

  • 病毒测序也可用于提供该病毒的存在的确认。
  • 此外，从临床病例标本的百分比的常规测序可以监控病毒基因组的突变可能影响医疗措施，包括诊断测试的性能非常有用。
  • 病毒全基因组测序还可以通知分子流行病学研究。

病毒培养（病毒分离）

  • 病毒分离，不建议作为常规诊断方法由于缺乏宽容的细胞系，获得结果，劳动力和专业知识的要求，并为文化的确认缺乏商业的抗血清。
  • SARS冠状病毒和MERS-CoV的和SARS-CoV的-2将在初级猴细胞和细胞系，如Vero细胞和LLC-MK2生长。尽管如此，细胞培养不应该在生物安全原因，常规诊断实验室的疑似病例进行。
  • 然而，细胞培养物中的病毒分离对于获得分子表征并支持疫苗和治疗剂的发育至关重要。

快速抗原测试

  • 快速抗原测试将提供快速的时间优势，结果和人类COVS的低成本检测，但是，它们可能是基于用这种方法对其他呼吸道病毒的经验，从敏感性降低的困扰。
  • 的胶体金标记的免疫球蛋白G（IgG）的作为检测试剂的结合是一种方法，其可以增加对呼吸道病毒快速抗原检测灵敏度。
  • 单克隆抗体，特异性针对SARS-CoV的-2，已下制备。的新方法，以浓缩抗原，或以放大所述检测阶段需要，如果这些方法被普遍使用。

更多的：https://www.who.int/news-room/commentaries/detail/advice-on-the-use-of-point-of-care-immunodiagnostic-tests-for-covid-19

COVID-19的IgG / IgM抗体快速测试

COVID-19 IgGIgM快速检测

  • IgM和IgG抗体对SARS-CoV的-2在血清，血浆（EDTA或柠檬酸盐）的定性检测，或来自怀疑COVID-19的个体静脉穿刺全血。
  • 给出2至10分钟内的结果。
  • 低灵敏度

阅读更多：COVID-19的IgG / IgM的快速检测抗体检测

电子显微镜

SARS-CoV的-2病毒颗粒的透射电子显微照片

图：透射电子SARS-CoV的-2病毒颗粒，从患者分离的显微照片。图像捕获并在德特里克堡，马里兰州NIAID综合研究机构（IRF）色彩增强。信用：野智

  • 该病毒的表面上的尖峰可在电子显微镜（这给冠状它的名字，意为皇冠）下观察到。

参考

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  2. 郭Y，计算机辅助工程Q，香港Z，等人。起源，传输和临床治疗冠状病毒病2019（COVID-19）爆发 - 上的状态更新。Millitary医疗Reasearch。（2020）7:11。https://doi.org/10.1186/s40779-020-00240-0
  3. 阿迪卡里等。流行病学，原因，在早期爆发期临床表现和诊断，预防和冠状疾病（COVID-19）控制：一作用域审查。贫穷的传染病。（2020）9:29。https://doi.org/10.1186/s40249-020-00646-X
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来源

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  • 4％ - https://www.3-14.com/post/covid19-testing
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  • 1％ - https://www.coursehero.com/file/191777/Homework-4-Outbreak-Investigation-Reading/

COVID-19的诊断


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