土壤样品中放线菌的分离

  • 放线菌是一种革兰氏阳性菌,具有独特的孢子形成能力和菌丝结构。
  • 它们表现出明显的化学和形态多样性,但形成了一个独特的生物进化线,从球粒状和多形性形态到分枝丝。
  • 这些细菌已被注意到用作药用抗生素的丰富储层,因此与科学家,制药行业和农业产业非常相关。

放线菌生态

数字:放线菌在土壤环境以及海洋和淡水生态系统中普遍存在。此外,它们在有机物的周转中具有重要的生态作用。许多放线菌已经进化到与植物、真菌、昆虫和动物共生。大多数放线菌与宿主的相互作用都是有益的,放线菌产生NPs,使宿主能够保护自己免受病原体或害虫的侵害,或酶降解木质纤维素等有弹性的天然聚合物。
图片来源:Gilles P. van Wezel,分子生物技术,莱顿大学生物研究所,Sylviusweg 72, 2333 BE Leiden荷兰。

放线菌分离原理

放线菌是一组常见的土壤微生物的非分类学术语,有时被称为“线或射线细菌”。众所周知,它们可以分解更耐腐蚀的有机物质,比如几丁质,这是一种存在于昆虫和其他地方的复杂糖。然而,存在于任何特定土壤中的放线菌的丰富度和多样性,在很大程度上受到土壤类型、地理位置、栽培和有机物等因素的影响。

不同的琼脂培养基可用于在稀释土壤浆料后从土壤样品中分离放线菌。放线菌分离琼脂是一种常用的选择性培养基。它含有酪蛋白酸钠作为氮源。芦笋除了作为氨基酸也是氮气的来源。丙酸钠用作厌氧发酵中的基材。磷酸二钾提供缓冲系统。硫酸盐用作硫和金属离子的来源。甘油用作额外的碳来源。琼脂中使用的环己酰亚胺和乳腺素,进一步通过抑制mRNA翻译来防止真菌干扰,从而引起机会性真菌的细胞生长停滞和细胞死亡。

另一方面,几丁质琼脂含有几丁质,这是一种通常被放线菌水解的复合糖。因此,它不仅能支持放线菌的生长,而且还能防止其他土壤细菌和真菌的生长。

放线菌的分离方法

放线菌的分离方法

  1. 首先,通过将1克的收集的干燥土壤悬浮在10mL蒸馏水中,通过悬浮土壤浆料制备。通过涡旋混合浆料2分钟。
  2. 10倍串联稀释液中的四个1由浆料制成。
  3. 然后通过在设定的琼脂平板上展开(补充有环己酰胺(50μg/ mL)和Nystatin(50μg/ ml)和丁蛋白琼脂/淀粉酪蛋白琼脂,通过在设定的琼脂平板上涂布1ml稀释件(放电网瘤分离琼脂(50μg/ ml)和胰蛋白酶/淀粉酪蛋白琼脂)。
  4. 将所有涂抹板标记并在25℃下孵育7至14天。
  5. 在第14天,计算和记录在每组两组中形成的菌落数。
  6. 所有培养皿在显微镜下仔细观察,以检测形成的菌落的多样性。计算并记录了丰富度、均匀度和多样性指数。
  7. 然后用无菌钳子挑出不同菌落类型,在葡萄糖酵母提取物琼脂平板上划线,获得纯单菌落。
  8. 然后将划线板进行培养,随后测试抗生素生产情况。

孤立的预期结果

  • 在补充有环己酰胺(50μg/ mL)和Nystatin(50μg/ ml)的放电瘤性分离琼脂,在孵育7天后,可以观察到与它们周围有明显的抑制区的照相销菌落。
  • 菌落外观为大的亮白色丝状网状菌丝,淡白色分枝丝状粉状外观,深褐色均匀且呈碎屑状外观,浅棕色外观边缘有纤毛状菌丝,深棕色外观嵌有同心圆形图案,黄色的菌落带有美丽的菌丝和透明的边界。
  • 几丁质琼脂上的一些放射瘤菌落被透明的水解区包围,促进了宏观识别。

参考

  1. 柯利,马米恩,马西姆,麦卡特尼,实用医学微生物学,1996,第14版,邱利文斯通。
  2. http://article.sapub.org/pdf/10.5923.j.microbiology.20140403.02.pdf.
  3. https://aem.asm.org/content/aem/29/3/422.full.pdf.
  4. https://pdfs.semanticscholar.org/5611/41ee7326d711cfd8851971e1dd5a5fda6af5.pdf
  5. https://www.researchgate.net/post/what_is_the_best_procedure_to_isolate_the_actinomcetes_from_soil.
  6. 刘志刚,刘志刚,2005,水和废水检测的标准方法,第21卷,美国水处理协会,华盛顿特区

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